More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0295 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0295  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  831    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.630234 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  65.32 
 
 
395 aa  566  1e-160  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0898  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.1 
 
 
429 aa  225  9e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0766  hypothetical protein  30.33 
 
 
455 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0812  hypothetical protein  31.25 
 
 
454 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0290283 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0813  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.33 
 
 
455 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0817  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.09 
 
 
455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0419  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.7 
 
 
450 aa  202  9e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1846  putative ferredoxin  29.58 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000698817  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0836  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.77 
 
 
447 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000205692  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1107  putative ferredoxin  30.14 
 
 
442 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0158261  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0539  hypothetical protein  28.87 
 
 
445 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835661  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2490  hypothetical protein  28.57 
 
 
445 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2280  Fe-S oxidoreductase-like  28.44 
 
 
445 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4115  Fe-S oxidoreductase-like protein  28.74 
 
 
445 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2628  hypothetical protein  28.11 
 
 
445 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3719  Fe-S oxidoreductase-like protein  28.9 
 
 
445 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.320551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2097  putative ferredoxin  27.75 
 
 
449 aa  176  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.263757 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5542  Fe-S oxidoreductase-like protein  28.6 
 
 
445 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4923  Fe-S oxidoreductase-like protein  27.88 
 
 
445 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0114822 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0269  hypothetical protein  28.34 
 
 
445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0922  putative ferredoxin  27.84 
 
 
445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3715  putative ferredoxin  28.51 
 
 
449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0539693  normal  0.153427 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1646  hypothetical protein  28.34 
 
 
445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277517  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0301  hypothetical protein  28.34 
 
 
445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2374  putative ferredoxin  26.65 
 
 
466 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.790506  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1449  hypothetical protein  28.11 
 
 
445 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.214428  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2673  putative ferredoxin  27.4 
 
 
454 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3708  Fe-S oxidoreductase-like protein  27.98 
 
 
445 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4547  Fe-S oxidoreductase-like  27.98 
 
 
445 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.975746  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3816  Fe-S oxidoreductase-like protein  27.98 
 
 
445 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3639  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  29.7 
 
 
456 aa  170  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000820206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2842  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  29.49 
 
 
396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000733482  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1519  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.48 
 
 
409 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.717289  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1125  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.04 
 
 
499 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0688  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.71 
 
 
413 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2807  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.71 
 
 
396 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.632443 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0202  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.2 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0158986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4113  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.25 
 
 
416 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal  0.0186832 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2514  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.57 
 
 
396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.444575  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2526  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.57 
 
 
396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2471  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.57 
 
 
396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.496093  normal  0.69733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2422  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.57 
 
 
396 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2630  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.57 
 
 
396 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.484622 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0567  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.43 
 
 
431 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0229  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.43 
 
 
415 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4561  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.72 
 
 
453 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3989  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.43 
 
 
415 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.379671  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1416  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  26.28 
 
 
396 aa  125  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3955  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.58 
 
 
403 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1408  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.28 
 
 
396 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2960  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  23.95 
 
 
448 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3380  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.28 
 
 
396 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2395  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.28 
 
 
396 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0395  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.51 
 
 
424 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02169  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), small subunit  26.02 
 
 
396 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2625  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.02 
 
 
396 aa  124  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2384  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.02 
 
 
396 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02128  hypothetical protein  26.02 
 
 
396 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4146  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.33 
 
 
403 aa  123  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2541  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.02 
 
 
396 aa  123  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3301  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.44 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0069  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.25 
 
 
409 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0514  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  32.2 
 
 
423 aa  119  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1469  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  28.69 
 
 
459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.789463  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2518  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  28.57 
 
 
461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0202  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.63 
 
 
400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0931  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  23.24 
 
 
478 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0250  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  29.49 
 
 
400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1019  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.32 
 
 
400 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  26.4 
 
 
973 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0866  FAD linked oxidase domain protein  22.14 
 
 
1020 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.8 
 
 
722 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2541  hypothetical protein  27.46 
 
 
446 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000879151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.27 
 
 
962 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0039  hypothetical protein  26.22 
 
 
431 aa  97.4  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157521 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  23.91 
 
 
1014 aa  96.7  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  27.01 
 
 
711 aa  96.7  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2766  Fe-S oxidoreductase  25.12 
 
 
423 aa  96.7  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000181716  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  26.06 
 
 
730 aa  96.7  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  26.81 
 
 
711 aa  96.3  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1012  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  24.36 
 
 
430 aa  96.3  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1047  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.63 
 
 
429 aa  93.6  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  26.06 
 
 
711 aa  93.6  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  23.5 
 
 
1024 aa  90.9  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3264  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.94 
 
 
428 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.726047  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2307  hypothetical protein  25.67 
 
 
423 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  25.93 
 
 
714 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  22.51 
 
 
996 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0393  hypothetical protein  25.36 
 
 
437 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.544976  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  22.46 
 
 
1055 aa  87  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.01 
 
 
1023 aa  86.7  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.13 
 
 
971 aa  87  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  25.88 
 
 
712 aa  86.3  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  24.44 
 
 
952 aa  86.3  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.6 
 
 
1035 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3052  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  24.81 
 
 
481 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0403  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  23.13 
 
 
490 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.864832 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1222  hypothetical protein  23.65 
 
 
432 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332946  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  24.38 
 
 
717 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>