68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3857 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3857  CitB domain-containing protein  100 
 
 		 377 aa  778    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000315554 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2503  putative ferredoxin  66.2 
 
 		 404 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5625  CitB domain protein  62.77 
 
 		 404 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0810  citrate utilization protein B  64.48 
 
 		 379 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.972731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0749  citrate utilization protein B  64.21 
 
 		 379 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.762495 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0846  citrate utilization protein B  64.21 
 
 		 379 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0737  citrate utilization protein B  64.21 
 
 		 379 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.580161  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0797  citrate utilization protein B  64.21 
 
 		 379 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5879  CitB domain-containing protein  62.53 
 
 		 404 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6133  CitB domain-containing protein  62.57 
 
 		 368 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6302  CitB domain-containing protein  61.29 
 
 		 400 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3134  CitB domain protein  60.1 
 
 		 408 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.870392  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6016  CitB domain-containing protein  61.54 
 
 		 404 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.66746 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4211  Citrate utilization protein B  63.19 
 
 		 390 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5147  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  61.6 
 
 		 403 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0793  CitB domain-containing protein  58.49 
 
 		 403 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4071  CitB domain-containing protein  58.71 
 
 		 408 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3416  CitB domain protein  58.45 
 
 		 408 aa  444  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3814  CitB domain-containing protein  62.64 
 
 		 394 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0640  citrate utilization protein B  65.94 
 
 		 395 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2087  CitB domain-containing protein  58.06 
 
 		 389 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0934488  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3489  citrate utilization protein B  61.1 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57381  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0620  citrate utilization protein B  53.7 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4212  putative citrate utilization protein B (citB)  47.89 
 
 		 372 aa  348  9e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8555  CitB domain protein  48.6 
 
 		 398 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.388597  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2275  CitB domain-containing protein  48.33 
 
 		 365 aa  323  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2723  CitB domain-containing protein  44.35 
 
 		 372 aa  293  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3552  CitB domain-containing protein  40.17 
 
 		 370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2322  citrate utilization protein B  39.94 
 
 		 376 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2382  CitB domain protein  39.3 
 
 		 378 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2987  hypothetical protein  38.95 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1892  citrate utilization protein B  35.79 
 
 		 372 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.494216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3176  citrate utilization protein B  38.6 
 
 		 379 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1834  heterodisulfide reductase, putative  25.07 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0759481  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1582  heterodisulfide reductase, putative  26.07 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00374998  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0035  heterodisulfide reductase, putative  24.8 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000417872  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3201  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  24.21 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2125  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  25.9 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1113  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  26.75 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0397617  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1963  quinone-interacting membrane-bound oxidoreductase complex subunit C  25.3 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829701 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2896  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  24.73 
 
 		 384 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.217971 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0295  hypothetical protein  32.71 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.630234 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0898  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.33 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1001  heterodisulfide reductase, putative  24.48 
 
 		 398 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.284636  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2133  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  22.52 
 
 		 384 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3715  putative ferredoxin  27.71 
 
 		 449 aa  49.7  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0539693  normal  0.153427 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4115  Fe-S oxidoreductase-like protein  25 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.79 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.82 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3708  Fe-S oxidoreductase-like protein  27.34 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3816  Fe-S oxidoreductase-like protein  27.34 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4547  Fe-S oxidoreductase-like  27.34 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.975746  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2374  putative ferredoxin  28.92 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.790506  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1846  putative ferredoxin  25.2 
 
 		 443 aa  47  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000698817  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1107  putative ferredoxin  24.63 
 
 		 442 aa  46.6  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0158261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2097  putative ferredoxin  25.88 
 
 		 449 aa  46.2  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.263757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2673  putative ferredoxin  25.88 
 
 		 454 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3719  Fe-S oxidoreductase-like protein  24.81 
 
 		 445 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.320551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2280  Fe-S oxidoreductase-like  26.12 
 
 		 445 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0539  hypothetical protein  25.19 
 
 		 445 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835661  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0836  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.74 
 
 		 447 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000205692  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4923  Fe-S oxidoreductase-like protein  25.86 
 
 		 445 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0114822 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5542  Fe-S oxidoreductase-like protein  24.03 
 
 		 445 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.65 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0419  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.92 
 
 		 450 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0352  hypothetical protein  29.66 
 
 		 281 aa  43.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0812  hypothetical protein  29.55 
 
 		 454 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0290283 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0813  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.57 
 
 		 455 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>