19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1221 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1221  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  652    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1458  hypothetical protein  30.83 
 
 		 246 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1928  conserved hypothetical protein DUF484  28.57 
 
 		 235 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0343023  hitchhiker  0.0000000244023 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2380  hypothetical protein  29.96 
 
 		 237 aa  89.4  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2808  hypothetical protein  29.54 
 
 		 225 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1031  hypothetical protein  25.66 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2214  hypothetical protein  28.64 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0562  hypothetical protein  28.64 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.536888  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1223  hypothetical protein  30.1 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540946  normal  0.173765 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2500  hypothetical protein  25.85 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.392304  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0221  hypothetical protein  24.87 
 
 		 186 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0239  hypothetical protein  27.83 
 
 		 226 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0893238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0317  hypothetical protein  26.27 
 
 		 244 aa  50.1  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3586  hypothetical protein  26.64 
 
 		 221 aa  47  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0127  hypothetical protein  23.31 
 
 		 233 aa  46.2  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4128  hypothetical protein  25.34 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.561037 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2543  hypothetical protein  26.64 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4075  hypothetical protein  24.34 
 
 		 232 aa  43.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0392  hypothetical protein  32.43 
 
 		 206 aa  43.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>