22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1458 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1458  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2380  hypothetical protein  32.75 
 
 		 237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1928  conserved hypothetical protein DUF484  31.47 
 
 		 235 aa  108  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0343023  hitchhiker  0.0000000244023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1031  hypothetical protein  33.63 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1223  hypothetical protein  32.57 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540946  normal  0.173765 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1221  hypothetical protein  30.83 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0562  hypothetical protein  31.19 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.536888  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2214  hypothetical protein  32.11 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0239  hypothetical protein  31.22 
 
 		 226 aa  86.3  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0893238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2808  hypothetical protein  29.66 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2500  hypothetical protein  26.41 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.392304  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0221  hypothetical protein  27.6 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0735  hypothetical protein  26.09 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0824  hypothetical protein  25.64 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.124637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0317  hypothetical protein  26.05 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2543  hypothetical protein  23.24 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0193  hypothetical protein  22.87 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0860  hypothetical protein  26.13 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3475  protein of unknown function DUF484  24.89 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0046  putative phytochrome sensor protein  24.45 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6022  hypothetical protein  22.5 
 
 		 233 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69700  hypothetical protein  22.5 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.536796  normal  0.526464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>