33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2808 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2808  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1928  conserved hypothetical protein DUF484  30.53 
 
 
235 aa  97.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0343023  hitchhiker  0.0000000244023 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2380  hypothetical protein  31.51 
 
 
237 aa  89.7  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1221  hypothetical protein  29.54 
 
 
328 aa  88.6  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1031  hypothetical protein  29.74 
 
 
247 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1223  hypothetical protein  31.44 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540946  normal  0.173765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1458  hypothetical protein  29.66 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0562  hypothetical protein  30.84 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.536888  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0239  hypothetical protein  31.94 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0893238  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2214  hypothetical protein  30.4 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2500  hypothetical protein  23.95 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.392304  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0184  hypothetical protein  25.84 
 
 
244 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0223  hypothetical protein  24.88 
 
 
244 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.282298  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3475  protein of unknown function DUF484  25.73 
 
 
224 aa  52  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0236  hypothetical protein  23.11 
 
 
227 aa  51.6  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0115318  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0221  hypothetical protein  28.49 
 
 
186 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04123  hypothetical protein  29.2 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0183  hypothetical protein  25.75 
 
 
234 aa  49.3  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.82752  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0317  hypothetical protein  22.94 
 
 
244 aa  48.9  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69700  hypothetical protein  22.37 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.536796  normal  0.526464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6022  hypothetical protein  22.37 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5500  hypothetical protein  24 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3114  hypothetical protein  24.23 
 
 
239 aa  45.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0233  hypothetical protein  35.9 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.832062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3248  hypothetical protein  24.17 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0206  hypothetical protein  25.65 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.464879  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0542  hypothetical protein  25.65 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4010  hypothetical protein  25.65 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0496  hypothetical protein  22.59 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3836  protein of unknown function DUF484  24.75 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130921  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0046  putative phytochrome sensor protein  22.84 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0062  hypothetical protein  25.93 
 
 
232 aa  42.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0324  hypothetical protein  29.82 
 
 
208 aa  41.6  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>