15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1223 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1223  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540946  normal  0.173765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0562  hypothetical protein  88.21 
 
 		 229 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.536888  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2214  hypothetical protein  88.21 
 
 		 229 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1031  hypothetical protein  61.23 
 
 		 247 aa  271  6e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2380  hypothetical protein  56.96 
 
 		 237 aa  250  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1928  conserved hypothetical protein DUF484  54.87 
 
 		 235 aa  246  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0343023  hitchhiker  0.0000000244023 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2500  hypothetical protein  49.78 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.392304  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1458  hypothetical protein  32.57 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2808  hypothetical protein  31.44 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1221  hypothetical protein  30.1 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0239  hypothetical protein  27.93 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0893238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0221  hypothetical protein  26.42 
 
 		 186 aa  52.4  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69700  hypothetical protein  25.45 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.536796  normal  0.526464 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0860  hypothetical protein  25.46 
 
 		 234 aa  41.6  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6022  hypothetical protein  25.89 
 
 		 233 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>