14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2380 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2380  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  477  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0562  hypothetical protein  58.7 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.536888  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2214  hypothetical protein  58.26 
 
 		 229 aa  262  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1031  hypothetical protein  57.52 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1223  hypothetical protein  56.96 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540946  normal  0.173765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1928  conserved hypothetical protein DUF484  51.11 
 
 		 235 aa  231  9e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0343023  hitchhiker  0.0000000244023 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2500  hypothetical protein  42.06 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.392304  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1458  hypothetical protein  32.75 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1221  hypothetical protein  29.96 
 
 		 328 aa  89.7  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2808  hypothetical protein  31.51 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0239  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0893238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0221  hypothetical protein  27.55 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0193  hypothetical protein  27.11 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0317  hypothetical protein  22.41 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>