11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0221 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0221  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  362  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1928  conserved hypothetical protein DUF484  28.87 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0343023  hitchhiker  0.0000000244023 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2380  hypothetical protein  27.55 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0562  hypothetical protein  29.08 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.536888  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2214  hypothetical protein  29.08 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1458  hypothetical protein  27.6 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1221  hypothetical protein  24.87 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1223  hypothetical protein  26.42 
 
 		 229 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540946  normal  0.173765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1031  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  51.6  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2808  hypothetical protein  28.49 
 
 		 225 aa  51.2  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0239  hypothetical protein  37.7 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0893238  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>