22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0239 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0239  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0893238  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1458  hypothetical protein  31.22 
 
 
246 aa  86.3  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2808  hypothetical protein  31.94 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1928  conserved hypothetical protein DUF484  29.88 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0343023  hitchhiker  0.0000000244023 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2380  hypothetical protein  28.57 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0562  hypothetical protein  28.57 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.536888  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2214  hypothetical protein  28.57 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1223  hypothetical protein  27.93 
 
 
229 aa  62.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540946  normal  0.173765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1031  hypothetical protein  26.52 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1221  hypothetical protein  27.83 
 
 
328 aa  55.5  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5290  hypothetical protein  28.45 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5229  hypothetical protein  28.45 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5138  hypothetical protein  28.45 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.850397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0243  hypothetical protein  28.45 
 
 
236 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.181438  normal  0.791089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0496  hypothetical protein  26.75 
 
 
249 aa  49.3  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0265  hypothetical protein  27 
 
 
232 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47720  hypothetical protein  30.26 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6022  hypothetical protein  28.99 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69700  hypothetical protein  28.99 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.536796  normal  0.526464 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0317  hypothetical protein  41.27 
 
 
244 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0221  hypothetical protein  37.7 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0735  hypothetical protein  27 
 
 
223 aa  41.6  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>