10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2500 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2500  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  457  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.392304  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1223  hypothetical protein  49.78 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540946  normal  0.173765 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2214  hypothetical protein  50.66 
 
 		 229 aa  205  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0562  hypothetical protein  50.66 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.536888  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1031  hypothetical protein  46.98 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1928  conserved hypothetical protein DUF484  43.17 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0343023  hitchhiker  0.0000000244023 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2380  hypothetical protein  42.06 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1458  hypothetical protein  26.41 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2808  hypothetical protein  23.95 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1221  hypothetical protein  25.85 
 
 		 328 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>