27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0900 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0900  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0936  hypothetical protein  43.1 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0277  hypothetical protein  41.7 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0804  hypothetical protein  41.91 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1004  hypothetical protein  41.22 
 
 		 247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4660  hypothetical protein  36.99 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.808713  normal  0.527012 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0754  hypothetical protein  34.38 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0743598 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0757  hypothetical protein  33.85 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.927883  normal  0.207116 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1347  hypothetical protein  33.2 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.717516 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3691  hypothetical protein  32.78 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0083  hypothetical protein  30.97 
 
 		 284 aa  118  7e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3792  hypothetical protein  31.11 
 
 		 270 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.170874  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0659  hypothetical protein  31.11 
 
 		 270 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.301026  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3880  hypothetical protein  31.11 
 
 		 270 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1269  sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  27.49 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3186  hypothetical protein  32.03 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000309505  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5094  hypothetical protein  25.97 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3667  hypothetical protein  28.93 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0140  hypothetical protein  26.61 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0582  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1065  hypothetical protein  27.23 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5100  hypothetical protein  24.9 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4764  hypothetical protein  28.18 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3010  hypothetical protein  30.38 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000572637  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33890  predicted HAD superfamily hydrolase  28.99 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.531552  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0343  hypothetical protein  24.26 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2492  hypothetical protein  27.75 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>