22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3880 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3880  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  568  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0659  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  568  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.301026  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3792  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  568  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.170874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1347  hypothetical protein  66.93 
 
 		 257 aa  374  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.717516 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3691  hypothetical protein  64.45 
 
 		 260 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0277  hypothetical protein  37.4 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0936  hypothetical protein  36.29 
 
 		 252 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0804  hypothetical protein  35.6 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0754  hypothetical protein  35.88 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0743598 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0757  hypothetical protein  36.74 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.927883  normal  0.207116 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4660  hypothetical protein  38.71 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.808713  normal  0.527012 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0083  hypothetical protein  37.31 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1004  hypothetical protein  33.46 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0900  hypothetical protein  31.84 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1269  sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  28.06 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0140  hypothetical protein  25.93 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5100  hypothetical protein  25.1 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2492  hypothetical protein  26.67 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5094  hypothetical protein  24.24 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4764  hypothetical protein  23.61 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3186  hypothetical protein  23.4 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000309505  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0343  hypothetical protein  24.8 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>