17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0757 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0757  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  553  1e-157  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.927883  normal  0.207116 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0754  hypothetical protein  87.31 
 
 
268 aa  483  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0743598 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0083  hypothetical protein  64.21 
 
 
284 aa  334  1e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1347  hypothetical protein  39.16 
 
 
257 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.717516 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3792  hypothetical protein  36.74 
 
 
270 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.170874  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0659  hypothetical protein  36.74 
 
 
270 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.301026  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3880  hypothetical protein  36.74 
 
 
270 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3691  hypothetical protein  36.5 
 
 
260 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0277  hypothetical protein  35.04 
 
 
252 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0900  hypothetical protein  33.85 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0804  hypothetical protein  31.1 
 
 
252 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0936  hypothetical protein  31.5 
 
 
252 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4660  hypothetical protein  30.94 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.808713  normal  0.527012 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1004  hypothetical protein  28.4 
 
 
247 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1269  sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  28.24 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2492  hypothetical protein  27.68 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4764  hypothetical protein  22.87 
 
 
287 aa  42.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>