19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1004 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1004  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  512  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0900  hypothetical protein  41.22 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4660  hypothetical protein  33.47 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.808713  normal  0.527012 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1269  sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  30.36 
 
 		 253 aa  118  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1347  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.717516 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3792  hypothetical protein  33.46 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.170874  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0659  hypothetical protein  33.46 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.301026  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3880  hypothetical protein  33.46 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3691  hypothetical protein  34.94 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0754  hypothetical protein  29.25 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0743598 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0757  hypothetical protein  28.4 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.927883  normal  0.207116 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0083  hypothetical protein  29.66 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0936  hypothetical protein  28.69 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0277  hypothetical protein  30.8 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0804  hypothetical protein  29.51 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2492  hypothetical protein  27.07 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3186  hypothetical protein  25.95 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000309505  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5094  hypothetical protein  22.41 
 
 		 271 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3667  hypothetical protein  24.41 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>