19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0754 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0754  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  555  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0743598 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0757  hypothetical protein  87.31 
 
 
269 aa  483  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.927883  normal  0.207116 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0083  hypothetical protein  63.2 
 
 
284 aa  329  3e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1347  hypothetical protein  37.79 
 
 
257 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.717516 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3691  hypothetical protein  35.14 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0277  hypothetical protein  36 
 
 
252 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3880  hypothetical protein  35.88 
 
 
270 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3792  hypothetical protein  35.88 
 
 
270 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.170874  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0659  hypothetical protein  35.88 
 
 
270 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.301026  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0804  hypothetical protein  32.17 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0900  hypothetical protein  34.38 
 
 
254 aa  135  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0936  hypothetical protein  32.03 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4660  hypothetical protein  30.98 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.808713  normal  0.527012 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1004  hypothetical protein  29.25 
 
 
247 aa  106  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1269  sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  29.46 
 
 
253 aa  94  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2492  hypothetical protein  25.7 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0582  hypothetical protein  22.27 
 
 
278 aa  48.9  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3186  hypothetical protein  23.29 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000309505  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4764  hypothetical protein  28.87 
 
 
287 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>