21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0936 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0936  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0804  hypothetical protein  95.24 
 
 		 252 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0277  hypothetical protein  67.73 
 
 		 252 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0900  hypothetical protein  43.1 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3691  hypothetical protein  36.44 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3880  hypothetical protein  36.29 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0659  hypothetical protein  36.29 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.301026  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3792  hypothetical protein  36.29 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.170874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1347  hypothetical protein  35.22 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.717516 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0754  hypothetical protein  32.03 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0743598 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0083  hypothetical protein  33.84 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4660  hypothetical protein  34.4 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.808713  normal  0.527012 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0757  hypothetical protein  31.5 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.927883  normal  0.207116 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1004  hypothetical protein  28.69 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1269  sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  28 
 
 		 253 aa  94.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3304  hypothetical protein  28.32 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341981  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3186  hypothetical protein  26 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000309505  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33890  predicted HAD superfamily hydrolase  28.72 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.531552  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1065  hypothetical protein  29.1 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0343  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0582  hypothetical protein  24.6 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>