19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1065 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1065  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  553  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3667  hypothetical protein  66.04 
 
 
289 aa  315  4e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3010  hypothetical protein  50.38 
 
 
274 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000572637  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3186  hypothetical protein  48.66 
 
 
294 aa  202  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000309505  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33890  predicted HAD superfamily hydrolase  47.92 
 
 
307 aa  194  9e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.531552  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5094  hypothetical protein  36.07 
 
 
271 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4764  hypothetical protein  41.83 
 
 
287 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5100  hypothetical protein  35.5 
 
 
271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0343  hypothetical protein  37.31 
 
 
259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0140  hypothetical protein  35.74 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3304  hypothetical protein  43.48 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341981  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0582  hypothetical protein  35.32 
 
 
278 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0900  hypothetical protein  27.66 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0936  hypothetical protein  31.56 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3691  hypothetical protein  25.79 
 
 
260 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0804  hypothetical protein  30.33 
 
 
252 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0277  hypothetical protein  30.71 
 
 
252 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4660  hypothetical protein  27.68 
 
 
251 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.808713  normal  0.527012 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1004  hypothetical protein  23.92 
 
 
247 aa  43.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>