18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3010 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3010  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  534  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000572637  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4764  hypothetical protein  51.45 
 
 		 287 aa  256  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3186  hypothetical protein  54.86 
 
 		 294 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000309505  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33890  predicted HAD superfamily hydrolase  47.27 
 
 		 307 aa  228  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.531552  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3667  hypothetical protein  50 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1065  hypothetical protein  50.78 
 
 		 283 aa  195  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5094  hypothetical protein  33.72 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3304  hypothetical protein  46.04 
 
 		 275 aa  166  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341981  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0140  hypothetical protein  33.46 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5100  hypothetical protein  33.85 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0343  hypothetical protein  34.09 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0582  hypothetical protein  36.02 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0900  hypothetical protein  30.4 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4660  hypothetical protein  26.83 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.808713  normal  0.527012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0277  hypothetical protein  30.17 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0804  hypothetical protein  27.54 
 
 		 252 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1347  hypothetical protein  29.13 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.717516 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0936  hypothetical protein  27.54 
 
 		 252 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>