23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4764 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4764  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  579  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3010  hypothetical protein  51.85 
 
 
274 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000572637  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3186  hypothetical protein  47.94 
 
 
294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000309505  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33890  predicted HAD superfamily hydrolase  41.16 
 
 
307 aa  202  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.531552  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3667  hypothetical protein  43.7 
 
 
289 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5094  hypothetical protein  35.21 
 
 
271 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5100  hypothetical protein  33.46 
 
 
271 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1065  hypothetical protein  41.18 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0140  hypothetical protein  32.96 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0343  hypothetical protein  32.45 
 
 
259 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0582  hypothetical protein  33.47 
 
 
278 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3304  hypothetical protein  40.5 
 
 
275 aa  132  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341981  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0900  hypothetical protein  27.63 
 
 
254 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0277  hypothetical protein  30.77 
 
 
252 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4660  hypothetical protein  23.62 
 
 
251 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.808713  normal  0.527012 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3691  hypothetical protein  23.62 
 
 
260 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0659  hypothetical protein  23.61 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.301026  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3880  hypothetical protein  23.61 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3792  hypothetical protein  23.61 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.170874  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  23.98 
 
 
544 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  23.98 
 
 
543 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0754  hypothetical protein  28.87 
 
 
268 aa  43.1  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0743598 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0757  hypothetical protein  22.87 
 
 
269 aa  42.4  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.927883  normal  0.207116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>