18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3304 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3304  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  530  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341981  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3010  hypothetical protein  46.04 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000572637  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3186  hypothetical protein  44.65 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000309505  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33890  predicted HAD superfamily hydrolase  40.43 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.531552  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4764  hypothetical protein  40.5 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1065  hypothetical protein  44.19 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3667  hypothetical protein  45.56 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5094  hypothetical protein  35.69 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5100  hypothetical protein  35.66 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0140  hypothetical protein  35.29 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0582  hypothetical protein  34.5 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0343  hypothetical protein  32.58 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0936  hypothetical protein  28.32 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0277  hypothetical protein  28.51 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0804  hypothetical protein  28.32 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1347  hypothetical protein  24.52 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.717516 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3691  hypothetical protein  26.54 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4660  hypothetical protein  24.67 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.808713  normal  0.527012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>