20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0343 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0343  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0582  hypothetical protein  57.51 
 
 
278 aa  296  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5100  hypothetical protein  43.51 
 
 
271 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5094  hypothetical protein  43.51 
 
 
271 aa  222  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0140  hypothetical protein  43.13 
 
 
271 aa  222  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3186  hypothetical protein  35.88 
 
 
294 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000309505  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3667  hypothetical protein  34.09 
 
 
289 aa  152  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1065  hypothetical protein  37.75 
 
 
283 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33890  predicted HAD superfamily hydrolase  34.93 
 
 
307 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.531552  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3010  hypothetical protein  34.09 
 
 
274 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000572637  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4764  hypothetical protein  32.45 
 
 
287 aa  136  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3304  hypothetical protein  32.92 
 
 
275 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341981  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0900  hypothetical protein  24.26 
 
 
254 aa  52.8  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0804  hypothetical protein  27.27 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0277  hypothetical protein  24.79 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0936  hypothetical protein  25 
 
 
252 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3792  hypothetical protein  24.8 
 
 
270 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.170874  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0659  hypothetical protein  24.8 
 
 
270 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.301026  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3880  hypothetical protein  24.8 
 
 
270 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2242  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  26.34 
 
 
263 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>