21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3691 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3691  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1347  hypothetical protein  73.83 
 
 
257 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.717516 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3880  hypothetical protein  64.45 
 
 
270 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0659  hypothetical protein  64.45 
 
 
270 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.301026  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3792  hypothetical protein  64.45 
 
 
270 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.170874  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0936  hypothetical protein  36.44 
 
 
252 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0754  hypothetical protein  35.14 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0743598 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0804  hypothetical protein  36.03 
 
 
252 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0757  hypothetical protein  36.5 
 
 
269 aa  149  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.927883  normal  0.207116 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4660  hypothetical protein  37.94 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.808713  normal  0.527012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0277  hypothetical protein  34.38 
 
 
252 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0083  hypothetical protein  36.16 
 
 
284 aa  145  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0900  hypothetical protein  32.78 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1004  hypothetical protein  34.94 
 
 
247 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1269  sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  27.04 
 
 
253 aa  79  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2492  hypothetical protein  29.02 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1065  hypothetical protein  25.79 
 
 
283 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4764  hypothetical protein  23.62 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3667  hypothetical protein  27.31 
 
 
289 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3304  hypothetical protein  27.62 
 
 
275 aa  45.8  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341981  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3186  hypothetical protein  23.64 
 
 
294 aa  45.4  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000309505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>