More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2487 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2487  Prolyl aminopeptidase  100 
 
 		 314 aa  616  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2093  Prolyl aminopeptidase  91.4 
 
 		 314 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0430181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1698  prolyl aminopeptidase  41.32 
 
 		 320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  37.54 
 
 		 315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2835  proline iminopeptidase  41.24 
 
 		 337 aa  162  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5970  prolyl aminopeptidase  44.98 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.630561  normal  0.0116459 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  32.74 
 
 		 313 aa  160  4e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  36.81 
 
 		 319 aa  159  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  37.62 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3058  Prolyl aminopeptidase  38.67 
 
 		 329 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  35.15 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  37.82 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  32.72 
 
 		 335 aa  156  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  35.16 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  31.47 
 
 		 318 aa  155  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  37.71 
 
 		 333 aa  153  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5896  prolyl aminopeptidase  42.32 
 
 		 334 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.429774 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0712  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  37 
 
 		 314 aa  152  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0121198  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6163  prolyl aminopeptidase  44.49 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1031  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  38.51 
 
 		 298 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  35.61 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6305  proline iminopeptidase  37.81 
 
 		 329 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1737  proline iminopeptidase  37.58 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.146462  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  39.1 
 
 		 313 aa  149  7e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  39.1 
 
 		 313 aa  149  7e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  39.46 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  35.07 
 
 		 316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  38.04 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  35.07 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  37.2 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  33.8 
 
 		 323 aa  146  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  36.61 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  36.61 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  36.39 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0733  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 		 365 aa  146  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0844225  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  35.23 
 
 		 316 aa  145  9e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  35.33 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4151  proline iminopeptidase  38.03 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  35.19 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  34.97 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  34.72 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  34.73 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  34.97 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  34.62 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3244  prolyl aminopeptidase  40.32 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655729  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  38.74 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5124  prolyl aminopeptidase  40.32 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  34.27 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1894  proline iminopeptidase  37.68 
 
 		 329 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0314  proline iminopeptidase  37.98 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  36.55 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  36.36 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8864  Prolyl aminopeptidase  36.34 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  36.46 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  37.83 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0330  proline iminopeptidase  37.98 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  36.45 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1122  proline iminopeptidase  37.34 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.29642  normal  0.0858208 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  33.97 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1088  proline iminopeptidase  37.14 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0407  proline iminopeptidase  38.43 
 
 		 316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  35.44 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  34.64 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3668  proline iminopeptidase  36.88 
 
 		 330 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1174  prolyl aminopeptidase  37.68 
 
 		 321 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4410  proline iminopeptidase  35.42 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.34926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  34.88 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  34.59 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0084  prolyl aminopeptidase  34.94 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2767  proline iminopeptidase  37.68 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2836  proline iminopeptidase  37.32 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  35.25 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  34.31 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3951  proline iminopeptidase  32.17 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2056  proline iminopeptidase  35.06 
 
 		 324 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  34.59 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  35.19 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3473  proline iminopeptidase  37.89 
 
 		 329 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.598272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  33.22 
 
 		 317 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  33.22 
 
 		 317 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  34.83 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  35 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  34.83 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  34.83 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  35 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04709  prolyl aminopeptidase protein  34.29 
 
 		 320 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1598  proline iminopeptidase  33.92 
 
 		 329 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  35 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  34.48 
 
 		 436 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  36.18 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2466  prolyl aminopeptidase  41.24 
 
 		 346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186961 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  35.69 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  37.02 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  37.46 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03529  proline iminopeptidase  30.72 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  36.33 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  35.37 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2907  prolyl aminopeptidase  32.98 
 
 		 326 aa  129  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5157  prolyl aminopeptidase  40.26 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.929702 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1856  proline iminopeptidase  33.44 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.0201858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>