More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6163 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6163  prolyl aminopeptidase  100 
 
 		 334 aa  648    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5896  prolyl aminopeptidase  94.31 
 
 		 334 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.429774 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5970  prolyl aminopeptidase  76.3 
 
 		 338 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.630561  normal  0.0116459 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3244  prolyl aminopeptidase  69.09 
 
 		 338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5124  prolyl aminopeptidase  69.09 
 
 		 338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5157  prolyl aminopeptidase  71.24 
 
 		 338 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.929702 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2466  prolyl aminopeptidase  61.56 
 
 		 346 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186961 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1698  prolyl aminopeptidase  43.54 
 
 		 320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  38.21 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  36.96 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  40.85 
 
 		 332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  36.96 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  39.93 
 
 		 316 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  37.5 
 
 		 323 aa  179  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  38.31 
 
 		 320 aa  179  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  39.8 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  38.98 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3058  Prolyl aminopeptidase  39.66 
 
 		 329 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  36.15 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  41.02 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  36.42 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  36.93 
 
 		 323 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  36.93 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  36.42 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  36.42 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2093  Prolyl aminopeptidase  43.71 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0430181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  39.72 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  32.99 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2487  Prolyl aminopeptidase  44.49 
 
 		 314 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  38.25 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  38.05 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  37.76 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  37.76 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  38.87 
 
 		 313 aa  165  8e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  36.3 
 
 		 323 aa  165  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  37.25 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  38.52 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2835  proline iminopeptidase  44.84 
 
 		 337 aa  163  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  37.46 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04709  prolyl aminopeptidase protein  37.05 
 
 		 320 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8864  Prolyl aminopeptidase  37.67 
 
 		 319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  37.78 
 
 		 318 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  40.21 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4410  proline iminopeptidase  35.93 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.34926 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1088  proline iminopeptidase  38.11 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1598  proline iminopeptidase  38.01 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  33.45 
 
 		 318 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  33.77 
 
 		 318 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0712  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  36.46 
 
 		 314 aa  159  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0121198  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  34.69 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  40.26 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  35.86 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03901  proline iminopeptidase  30.74 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0624161  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  36.42 
 
 		 310 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  34.34 
 
 		 317 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  37.63 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  30.98 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  33.56 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0360  proline iminopeptidase  30.74 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2620  proline iminopeptidase  38.93 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000526602  normal  0.51631 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  36.12 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0503  proline iminopeptidase  35.79 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.624874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  36.24 
 
 		 318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  36.09 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  33.67 
 
 		 320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  39.21 
 
 		 429 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2994  prolyl aminopeptidase  35.88 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0267164  normal  0.7335 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03911  proline iminopeptidase  30.41 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480314  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  39.21 
 
 		 429 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  36.09 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  39.21 
 
 		 429 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  36.09 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  39.21 
 
 		 312 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  39.21 
 
 		 312 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3473  proline iminopeptidase  38.78 
 
 		 329 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.598272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  36.58 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  34.47 
 
 		 317 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  38.85 
 
 		 414 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  37.89 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  39.21 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  36.84 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  33.11 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  36.48 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  36.24 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  36.84 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03961  proline iminopeptidase  31.23 
 
 		 313 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  33.11 
 
 		 316 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4387  proline iminopeptidase  36.84 
 
 		 326 aa  149  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0168  proline iminopeptidase  33.77 
 
 		 323 aa  149  9e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1737  proline iminopeptidase  38.1 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.146462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  33.33 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1894  proline iminopeptidase  37.54 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  33.11 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  34.23 
 
 		 316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0084  prolyl aminopeptidase  36.99 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0717  proline iminopeptidase  33.45 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.922147  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2907  prolyl aminopeptidase  33.11 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4358  proline iminopeptidase  33.97 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0513684  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2767  proline iminopeptidase  36.36 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4151  proline iminopeptidase  38.41 
 
 		 329 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>