More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5896 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5896  prolyl aminopeptidase  100 
 
 
334 aa  648    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.429774 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6163  prolyl aminopeptidase  94.31 
 
 
334 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5970  prolyl aminopeptidase  75 
 
 
338 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.630561  normal  0.0116459 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3244  prolyl aminopeptidase  65.58 
 
 
338 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5124  prolyl aminopeptidase  65.58 
 
 
338 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236769  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5157  prolyl aminopeptidase  70.63 
 
 
338 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.929702 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2466  prolyl aminopeptidase  61.56 
 
 
346 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186961 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1698  prolyl aminopeptidase  43.01 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  39.21 
 
 
319 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3058  Prolyl aminopeptidase  41.03 
 
 
329 aa  185  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  40.72 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  36.18 
 
 
323 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  36.51 
 
 
323 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  40.41 
 
 
320 aa  172  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  34.01 
 
 
323 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2093  Prolyl aminopeptidase  43.01 
 
 
314 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0430181  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2487  Prolyl aminopeptidase  42.32 
 
 
314 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  37.16 
 
 
320 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  39.38 
 
 
333 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  36.18 
 
 
323 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  40.27 
 
 
323 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  37.88 
 
 
316 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  37.5 
 
 
319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  36.16 
 
 
323 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  37.76 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  36.16 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  37.76 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  39.37 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8864  Prolyl aminopeptidase  38.14 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  35.59 
 
 
323 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  36.27 
 
 
323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2835  proline iminopeptidase  44.13 
 
 
337 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  39.03 
 
 
313 aa  162  6e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  37 
 
 
329 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1088  proline iminopeptidase  37 
 
 
326 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_003296  RS04709  prolyl aminopeptidase protein  36.36 
 
 
320 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  38.66 
 
 
313 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  35.93 
 
 
323 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  35.93 
 
 
323 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  36.3 
 
 
328 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  37.64 
 
 
318 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  38.28 
 
 
320 aa  158  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  36.67 
 
 
328 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  35.53 
 
 
323 aa  156  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4410  proline iminopeptidase  35.93 
 
 
321 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.34926 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  39.86 
 
 
321 aa  156  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  33.22 
 
 
318 aa  155  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0712  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  36.11 
 
 
314 aa  155  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0121198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1598  proline iminopeptidase  36.21 
 
 
329 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  33.11 
 
 
318 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2620  proline iminopeptidase  37.99 
 
 
320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000526602  normal  0.51631 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  34.98 
 
 
313 aa  152  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  34.6 
 
 
335 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  35.61 
 
 
317 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  33.78 
 
 
320 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  33.67 
 
 
320 aa  152  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  34.01 
 
 
320 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0503  proline iminopeptidase  35.88 
 
 
326 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.624874 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  38.85 
 
 
312 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  38.85 
 
 
312 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  35.03 
 
 
317 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  37.89 
 
 
429 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  36.24 
 
 
311 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  36.55 
 
 
318 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  37.89 
 
 
429 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  37.89 
 
 
429 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  37.54 
 
 
436 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  37.73 
 
 
313 aa  149  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  39.54 
 
 
308 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  37.54 
 
 
414 aa  149  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  37.89 
 
 
312 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  35.62 
 
 
310 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  36.36 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  36.36 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  36.36 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  30.9 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03901  proline iminopeptidase  29.97 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0624161  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2994  prolyl aminopeptidase  35 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0267164  normal  0.7335 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0360  proline iminopeptidase  30 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03911  proline iminopeptidase  29.97 
 
 
316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480314  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  37.06 
 
 
310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  37.06 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  33.89 
 
 
316 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4387  proline iminopeptidase  35.29 
 
 
326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  36.11 
 
 
310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  34.75 
 
 
319 aa  146  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  33.11 
 
 
316 aa  145  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  33.11 
 
 
316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1737  proline iminopeptidase  38.1 
 
 
316 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.146462  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1894  proline iminopeptidase  36.78 
 
 
329 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0717  proline iminopeptidase  34.62 
 
 
320 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.922147  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3473  proline iminopeptidase  37.16 
 
 
329 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.598272  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2907  prolyl aminopeptidase  31.53 
 
 
326 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf626  proline iminopeptidase  28.38 
 
 
315 aa  144  2e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1031  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  37.76 
 
 
298 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0168  proline iminopeptidase  33.99 
 
 
323 aa  144  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  32.77 
 
 
316 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2191  prolyl aminopeptidase  35.71 
 
 
321 aa  143  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.73475  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2767  proline iminopeptidase  36.75 
 
 
322 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03529  proline iminopeptidase  29.29 
 
 
325 aa  143  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>