40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4437 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4437  flagellar biosynthesis repressor FlbT  100 
 
 
126 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3799  flagellar biosynthesis repressor FlbT  92.86 
 
 
126 aa  241  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1672  flagellar biosynthesis repressor FlbT  92.86 
 
 
126 aa  240  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1491  flagellar biosynthesis repressor FlbT  88.71 
 
 
125 aa  227  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.194019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0523  flagellar biosynthesis repressor FlbT  54.4 
 
 
131 aa  141  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2550  flagellar FlbT family protein  54.84 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.998924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1103  flagellar biosynthesis repressor FlbT  51.61 
 
 
142 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.268385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1335  flagellar biosynthesis repressor FlbT  50.81 
 
 
143 aa  121  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5529  flagellar biosynthesis repressor FlbT  48.6 
 
 
129 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3373  flagellar FlbT family protein  38.4 
 
 
139 aa  99.4  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438909  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3744  flagellar FlbT family protein  41.6 
 
 
129 aa  97.1  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3828  flagellar FlbT family protein  40.8 
 
 
129 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0340484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1195  flagellar FlbT family protein  37.1 
 
 
138 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3334  flagellar FlbT family protein  34.65 
 
 
128 aa  87.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1409  flagellar FlbT family protein  36.29 
 
 
138 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1248  flagellar FlbT family protein  36.29 
 
 
138 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1964  flagellar biosynthesis repressor FlbT  40.77 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616772  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2371  hypothetical protein  37.5 
 
 
188 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.771214  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5400  flagellar FlbT family protein  36.67 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2889  flagellar biosynthesis repressor FlbT  36.92 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078203  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5763  flagellar FlbT family protein  28.8 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0687  flagellar FlbT family protein  32.54 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0957504  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1492  flagellar FlbT family protein  32 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2857  flagellar FlbT  35.43 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.920076  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2541  hypothetical protein  34.48 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2972  flagellar biosynthesis repressor FlbT  34.13 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.229267 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4201  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.23 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.883513  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4160  flagellar biosynthesis repressor FlbT  32.56 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00283786  normal  0.231077 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3880  flagellar biosynthesis repressor FlbT  32.56 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0966721  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3359  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.46 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0275  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.78 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0046  flagellar biosynthesis repressor FlbT  23.81 
 
 
136 aa  50.8  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1135  flagellar biosynthesis repressor FlbT  24.03 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.405413  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1040  flagellar biosynthesis repressor FlbT  24.03 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4189  flagellar biosynthesis repressor FlbT  25.58 
 
 
152 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408027  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1115  flagellar biosynthesis repressor FlbT  26.72 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0768  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.12 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1118  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.23 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3553  flagellar biosynthesis repressor FlbT  22.22 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.646501 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0280  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.34 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743956  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>