40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1195 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1195  flagellar FlbT family protein  100 
 
 
138 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1248  flagellar FlbT family protein  92.03 
 
 
138 aa  256  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1409  flagellar FlbT family protein  92.03 
 
 
138 aa  256  7e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1492  flagellar FlbT family protein  72.58 
 
 
139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0687  flagellar FlbT family protein  67.74 
 
 
152 aa  174  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0957504  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5763  flagellar FlbT family protein  60.48 
 
 
134 aa  158  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5400  flagellar FlbT family protein  61.67 
 
 
137 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2550  flagellar FlbT family protein  39.37 
 
 
130 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.998924 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3828  flagellar FlbT family protein  39.37 
 
 
129 aa  97.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0340484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3744  flagellar FlbT family protein  39.37 
 
 
129 aa  97.1  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3334  flagellar FlbT family protein  34.38 
 
 
128 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3373  flagellar FlbT family protein  35.29 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438909  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4437  flagellar biosynthesis repressor FlbT  37.1 
 
 
126 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1672  flagellar biosynthesis repressor FlbT  37.1 
 
 
126 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3799  flagellar biosynthesis repressor FlbT  37.1 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1491  flagellar biosynthesis repressor FlbT  37.9 
 
 
125 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.194019 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1103  flagellar biosynthesis repressor FlbT  34.92 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.268385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1335  flagellar biosynthesis repressor FlbT  36.51 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2889  flagellar biosynthesis repressor FlbT  34.35 
 
 
131 aa  84.3  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078203  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1964  flagellar biosynthesis repressor FlbT  33.86 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616772  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2857  flagellar FlbT  32.58 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.920076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0523  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5529  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.91 
 
 
129 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2972  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.56 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.229267 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3359  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.91 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3880  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0966721  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4160  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00283786  normal  0.231077 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4201  flagellar biosynthesis repressor FlbT  26.77 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.883513  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2541  hypothetical protein  28.68 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6510  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.29 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2371  hypothetical protein  28.21 
 
 
188 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.771214  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1115  flagellar biosynthesis repressor FlbT  24.6 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0687  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.54 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.149804  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0661  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.86 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.262146 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1118  flagellar biosynthesis repressor FlbT  36.36 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0342  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.11 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463686  normal  0.484811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0280  flagellar biosynthesis repressor FlbT  33.71 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743956  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0374  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.11 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154964  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0768  flagellar biosynthesis repressor FlbT  37.5 
 
 
149 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0698  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.77 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.191751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>