40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1335 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1335  flagellar biosynthesis repressor FlbT  100 
 
 
143 aa  290  5e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1103  flagellar biosynthesis repressor FlbT  86.01 
 
 
142 aa  248  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.268385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5529  flagellar biosynthesis repressor FlbT  79.25 
 
 
129 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2550  flagellar FlbT family protein  58.06 
 
 
130 aa  148  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.998924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1491  flagellar biosynthesis repressor FlbT  53.23 
 
 
125 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.194019 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4437  flagellar biosynthesis repressor FlbT  50.81 
 
 
126 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3799  flagellar biosynthesis repressor FlbT  49.19 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1672  flagellar biosynthesis repressor FlbT  48.39 
 
 
126 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3373  flagellar FlbT family protein  40.31 
 
 
139 aa  105  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438909  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0523  flagellar biosynthesis repressor FlbT  42.62 
 
 
131 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3334  flagellar FlbT family protein  38.4 
 
 
128 aa  92  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2857  flagellar FlbT  42.54 
 
 
148 aa  92  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.920076  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1248  flagellar FlbT family protein  34.59 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1409  flagellar FlbT family protein  34.59 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3744  flagellar FlbT family protein  38.93 
 
 
129 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1195  flagellar FlbT family protein  36.51 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3828  flagellar FlbT family protein  37.69 
 
 
129 aa  84.3  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0340484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0687  flagellar FlbT family protein  34.88 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0957504  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1492  flagellar FlbT family protein  35.16 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1964  flagellar biosynthesis repressor FlbT  33.87 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616772  normal 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5763  flagellar FlbT family protein  30.08 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5400  flagellar FlbT family protein  34.71 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2889  flagellar biosynthesis repressor FlbT  32.26 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078203  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4160  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.37 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00283786  normal  0.231077 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3880  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.37 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0966721  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2972  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.01 
 
 
134 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.229267 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2371  hypothetical protein  31.4 
 
 
188 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.771214  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4189  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.28 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408027  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4201  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.13 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.883513  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1135  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.57 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.405413  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1040  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.57 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2541  hypothetical protein  28.21 
 
 
184 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6510  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.08 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3359  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.61 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0275  flagellar biosynthesis repressor FlbT  25 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0342  flagellar biosynthesis repressor FlbT  26.32 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463686  normal  0.484811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0374  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.07 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154964  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1118  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.01 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0046  flagellar biosynthesis repressor FlbT  21.64 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0768  flagellar biosynthesis repressor FlbT  24.24 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>