39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1248 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1248  flagellar FlbT family protein  100 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1409  flagellar FlbT family protein  100 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1195  flagellar FlbT family protein  92.03 
 
 		 138 aa  256  7e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1492  flagellar FlbT family protein  74.19 
 
 		 139 aa  191  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0687  flagellar FlbT family protein  68.55 
 
 		 152 aa  178  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0957504  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5763  flagellar FlbT family protein  61.29 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5400  flagellar FlbT family protein  62.5 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2550  flagellar FlbT family protein  39.23 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998924 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3828  flagellar FlbT family protein  38.58 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0340484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3744  flagellar FlbT family protein  38.58 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3373  flagellar FlbT family protein  37.3 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438909  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3334  flagellar FlbT family protein  33.59 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4437  flagellar biosynthesis repressor FlbT  36.29 
 
 		 126 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1672  flagellar biosynthesis repressor FlbT  36.29 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2889  flagellar biosynthesis repressor FlbT  35.38 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078203  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1335  flagellar biosynthesis repressor FlbT  34.59 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3799  flagellar biosynthesis repressor FlbT  36.29 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1491  flagellar biosynthesis repressor FlbT  37.1 
 
 		 125 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.194019 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1103  flagellar biosynthesis repressor FlbT  34.13 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.268385 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1964  flagellar biosynthesis repressor FlbT  33.07 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2857  flagellar FlbT  31.62 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.920076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0523  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5529  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.97 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3359  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.47 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2972  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.35 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.229267 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3880  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.77 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0966721  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4160  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.77 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00283786  normal  0.231077 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4201  flagellar biosynthesis repressor FlbT  35.82 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.883513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2541  hypothetical protein  30.6 
 
 		 184 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2371  hypothetical protein  31.88 
 
 		 188 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.771214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1115  flagellar biosynthesis repressor FlbT  24.6 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6510  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.34 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1118  flagellar biosynthesis repressor FlbT  35.06 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0280  flagellar biosynthesis repressor FlbT  32.58 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0661  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.97 
 
 		 175 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.262146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0342  flagellar biosynthesis repressor FlbT  32.58 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463686  normal  0.484811 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0768  flagellar biosynthesis repressor FlbT  36.11 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0374  flagellar biosynthesis repressor FlbT  32.58 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0687  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.23 
 
 		 173 aa  40  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.149804  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>