39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1115 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1115  flagellar biosynthesis repressor FlbT  100 
 
 
138 aa  278  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0046  flagellar biosynthesis repressor FlbT  53.97 
 
 
136 aa  141  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0280  flagellar biosynthesis repressor FlbT  48.91 
 
 
149 aa  137  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743956  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0342  flagellar biosynthesis repressor FlbT  48.46 
 
 
149 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463686  normal  0.484811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3553  flagellar biosynthesis repressor FlbT  45.67 
 
 
133 aa  133  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.646501 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0374  flagellar biosynthesis repressor FlbT  48.46 
 
 
149 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154964  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6510  flagellar biosynthesis repressor FlbT  51.54 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0275  flagellar biosynthesis repressor FlbT  50 
 
 
145 aa  131  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0687  flagellar biosynthesis repressor FlbT  48.48 
 
 
173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.149804  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0698  flagellar biosynthesis repressor FlbT  47.73 
 
 
173 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0661  flagellar biosynthesis repressor FlbT  49.6 
 
 
175 aa  128  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.262146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0768  flagellar biosynthesis repressor FlbT  44.53 
 
 
149 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1703  flagellar biosynthesis repressor FlbT  45.24 
 
 
140 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.141944 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1118  flagellar biosynthesis repressor FlbT  45.86 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1040  flagellar biosynthesis repressor FlbT  44.96 
 
 
152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1135  flagellar biosynthesis repressor FlbT  44.96 
 
 
152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.405413  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4189  flagellar biosynthesis repressor FlbT  44.09 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408027  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2889  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.33 
 
 
131 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078203  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5138  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.57 
 
 
139 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.371461  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5523  flagellar FlbT family protein  32.8 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.726406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3744  flagellar FlbT family protein  26.83 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3828  flagellar FlbT family protein  27.64 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0340484 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3334  flagellar FlbT family protein  28.46 
 
 
128 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1964  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.05 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616772  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1492  flagellar FlbT family protein  26.28 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0687  flagellar FlbT family protein  26.47 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0957504  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1672  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.07 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3799  flagellar biosynthesis repressor FlbT  26.32 
 
 
126 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4437  flagellar biosynthesis repressor FlbT  26.72 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1195  flagellar FlbT family protein  24.6 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1248  flagellar FlbT family protein  24.6 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1409  flagellar FlbT family protein  24.6 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2550  flagellar FlbT family protein  25.95 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.998924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4201  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.58 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.883513  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3373  flagellar FlbT family protein  26.72 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438909  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5763  flagellar FlbT family protein  25 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5742  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.67 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3359  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.81 
 
 
133 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0107  flagellar biosynthesis regulator FlbT-like protein  28.12 
 
 
132 aa  40.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>