42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3359 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3359  flagellar biosynthesis repressor FlbT  100 
 
 		 133 aa  269  8.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2972  flagellar biosynthesis repressor FlbT  71.76 
 
 		 134 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.229267 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4201  flagellar biosynthesis repressor FlbT  70 
 
 		 134 aa  189  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.883513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4160  flagellar biosynthesis repressor FlbT  64.62 
 
 		 135 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00283786  normal  0.231077 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3880  flagellar biosynthesis repressor FlbT  64.62 
 
 		 135 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0966721  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1964  flagellar biosynthesis repressor FlbT  32.54 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2889  flagellar biosynthesis repressor FlbT  33.06 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078203  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4081  hypothetical protein  64.15 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13747  normal  0.0456765 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0280  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.91 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1491  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.25 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.194019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0275  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.37 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1672  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.25 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3373  flagellar FlbT family protein  28.79 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438909  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4437  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.46 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3799  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.47 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1409  flagellar FlbT family protein  30.47 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1248  flagellar FlbT family protein  30.47 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0768  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.34 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5763  flagellar FlbT family protein  33.08 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1195  flagellar FlbT family protein  28.91 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1040  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.13 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1135  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.13 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.405413  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4189  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.2 
 
 		 152 aa  52.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0687  flagellar FlbT family protein  33.07 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0957504  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3828  flagellar FlbT family protein  30.83 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0340484 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1118  flagellar biosynthesis repressor FlbT  25.2 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3334  flagellar FlbT family protein  27.91 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0342  flagellar biosynthesis repressor FlbT  26.56 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463686  normal  0.484811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1492  flagellar FlbT family protein  32.28 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0374  flagellar biosynthesis repressor FlbT  26.56 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2550  flagellar FlbT family protein  30.47 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3744  flagellar FlbT family protein  30.08 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1335  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.61 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1103  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.24 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.268385 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3553  flagellar biosynthesis repressor FlbT  26.4 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.646501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0661  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.65 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.262146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6510  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.4 
 
 		 151 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5400  flagellar FlbT family protein  36.36 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1115  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.81 
 
 		 138 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0687  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.45 
 
 		 173 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0523  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.17 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0698  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.65 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>