48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0768 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0768  flagellar biosynthesis repressor FlbT  100 
 
 
149 aa  303  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0280  flagellar biosynthesis repressor FlbT  83.89 
 
 
149 aa  265  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743956  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0342  flagellar biosynthesis repressor FlbT  83.89 
 
 
149 aa  260  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463686  normal  0.484811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0374  flagellar biosynthesis repressor FlbT  82.55 
 
 
149 aa  258  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154964  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0275  flagellar biosynthesis repressor FlbT  59.69 
 
 
145 aa  167  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1135  flagellar biosynthesis repressor FlbT  58.46 
 
 
152 aa  157  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.405413  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1040  flagellar biosynthesis repressor FlbT  58.46 
 
 
152 aa  157  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4189  flagellar biosynthesis repressor FlbT  59.38 
 
 
152 aa  156  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6510  flagellar biosynthesis repressor FlbT  49.23 
 
 
151 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0661  flagellar biosynthesis repressor FlbT  50.36 
 
 
175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.262146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0687  flagellar biosynthesis repressor FlbT  53.17 
 
 
173 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.149804  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0698  flagellar biosynthesis repressor FlbT  52.38 
 
 
173 aa  131  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3553  flagellar biosynthesis repressor FlbT  48.41 
 
 
133 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.646501 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0046  flagellar biosynthesis repressor FlbT  47.37 
 
 
136 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1118  flagellar biosynthesis repressor FlbT  52.8 
 
 
138 aa  129  9e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1115  flagellar biosynthesis repressor FlbT  44.53 
 
 
138 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1703  flagellar biosynthesis repressor FlbT  48.76 
 
 
140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.141944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2972  flagellar biosynthesis repressor FlbT  35.11 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.229267 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4201  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.47 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.883513  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3880  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.5 
 
 
135 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0966721  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4160  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.5 
 
 
135 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00283786  normal  0.231077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2889  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.35 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078203  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3334  flagellar FlbT family protein  32 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3828  flagellar FlbT family protein  29.69 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0340484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3744  flagellar FlbT family protein  28.91 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1964  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.1 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616772  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3359  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.34 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5523  flagellar FlbT family protein  36.23 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.726406  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5138  flagellar biosynthesis repressor FlbT  34.92 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.371461  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2550  flagellar FlbT family protein  28.03 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.998924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1491  flagellar biosynthesis repressor FlbT  32.03 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.194019 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0107  flagellar biosynthesis regulator FlbT-like protein  30.56 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1103  flagellar biosynthesis repressor FlbT  25.74 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.268385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3799  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.46 
 
 
126 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1672  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.68 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4437  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.12 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0687  flagellar FlbT family protein  30.53 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0957504  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3373  flagellar FlbT family protein  26.36 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438909  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0523  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.41 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5742  flagellar biosynthesis repressor FlbT  32.31 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5763  flagellar FlbT family protein  30.38 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1335  flagellar biosynthesis repressor FlbT  24.24 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1195  flagellar FlbT family protein  37.5 
 
 
138 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2857  flagellar FlbT  24.03 
 
 
148 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.920076  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1248  flagellar FlbT family protein  36.11 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1409  flagellar FlbT family protein  36.11 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1492  flagellar FlbT family protein  32.93 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5400  flagellar FlbT family protein  29.27 
 
 
137 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>