42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5763 on replicon NC_011760
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011760  Mchl_5763  flagellar FlbT family protein  100 
 
 
134 aa  276  9e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0687  flagellar FlbT family protein  60.48 
 
 
152 aa  167  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0957504  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1492  flagellar FlbT family protein  57.46 
 
 
139 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1248  flagellar FlbT family protein  61.29 
 
 
138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1409  flagellar FlbT family protein  61.29 
 
 
138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1195  flagellar FlbT family protein  60.48 
 
 
138 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5400  flagellar FlbT family protein  54.17 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2550  flagellar FlbT family protein  36.29 
 
 
130 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.998924 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3373  flagellar FlbT family protein  32.8 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3828  flagellar FlbT family protein  32.8 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0340484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3744  flagellar FlbT family protein  32 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1103  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.45 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.268385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3334  flagellar FlbT family protein  31.01 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4437  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.8 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1491  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.84 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.194019 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1964  flagellar biosynthesis repressor FlbT  43.28 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616772  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1335  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.08 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2541  hypothetical protein  39.23 
 
 
184 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0523  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.4 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1672  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.23 
 
 
126 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3799  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.23 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2371  hypothetical protein  34.48 
 
 
188 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.771214  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2889  flagellar biosynthesis repressor FlbT  38.03 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078203  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2857  flagellar FlbT  29.13 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.920076  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2972  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.229267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5529  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.1 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3359  flagellar biosynthesis repressor FlbT  33.08 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4201  flagellar biosynthesis repressor FlbT  25.78 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.883513  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4160  flagellar biosynthesis repressor FlbT  32.09 
 
 
135 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00283786  normal  0.231077 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3880  flagellar biosynthesis repressor FlbT  32.09 
 
 
135 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0966721  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0275  flagellar biosynthesis repressor FlbT  25.37 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0544  hypothetical protein  36.21 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1115  flagellar biosynthesis repressor FlbT  25 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6510  flagellar biosynthesis repressor FlbT  32.39 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0698  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.83 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0280  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.11 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743956  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0768  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.38 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0687  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.83 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.149804  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0661  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.57 
 
 
175 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.262146 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1118  flagellar biosynthesis repressor FlbT  32.39 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0374  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.05 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154964  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0342  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.05 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463686  normal  0.484811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>