22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2371 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_2371  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  380  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.771214  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2541  hypothetical protein  67.55 
 
 
184 aa  242  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1672  flagellar biosynthesis repressor FlbT  38.33 
 
 
126 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3799  flagellar biosynthesis repressor FlbT  37.5 
 
 
126 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4437  flagellar biosynthesis repressor FlbT  37.93 
 
 
126 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0523  flagellar biosynthesis repressor FlbT  38.02 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1491  flagellar biosynthesis repressor FlbT  36.21 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.194019 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5763  flagellar FlbT family protein  34.48 
 
 
134 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3334  flagellar FlbT family protein  31.15 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3373  flagellar FlbT family protein  32.84 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438909  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2857  flagellar FlbT  34.17 
 
 
148 aa  62.4  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.920076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3828  flagellar FlbT family protein  33.06 
 
 
129 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0340484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3744  flagellar FlbT family protein  32.23 
 
 
129 aa  61.2  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1492  flagellar FlbT family protein  31.9 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2550  flagellar FlbT family protein  32.2 
 
 
130 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.998924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1335  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.67 
 
 
143 aa  55.1  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1103  flagellar biosynthesis repressor FlbT  33.88 
 
 
142 aa  55.1  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.268385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0687  flagellar FlbT family protein  31.03 
 
 
152 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0957504  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5400  flagellar FlbT family protein  38.46 
 
 
137 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1195  flagellar FlbT family protein  28.21 
 
 
138 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1248  flagellar FlbT family protein  32.82 
 
 
138 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1409  flagellar FlbT family protein  32.82 
 
 
138 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  0.310522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>