47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3334 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3334  flagellar FlbT family protein  100 
 
 
128 aa  261  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3828  flagellar FlbT family protein  54.03 
 
 
129 aa  140  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0340484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3744  flagellar FlbT family protein  53.23 
 
 
129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3373  flagellar FlbT family protein  50 
 
 
139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438909  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2550  flagellar FlbT family protein  41.41 
 
 
130 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.998924 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2857  flagellar FlbT  41.09 
 
 
148 aa  95.9  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.920076  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1103  flagellar biosynthesis repressor FlbT  38.4 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.268385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1335  flagellar biosynthesis repressor FlbT  38.4 
 
 
143 aa  92  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1195  flagellar FlbT family protein  34.38 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1409  flagellar FlbT family protein  33.59 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1248  flagellar FlbT family protein  33.59 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2889  flagellar biosynthesis repressor FlbT  33.85 
 
 
131 aa  89.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078203  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1491  flagellar biosynthesis repressor FlbT  37.9 
 
 
125 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.194019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1672  flagellar biosynthesis repressor FlbT  36.29 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4437  flagellar biosynthesis repressor FlbT  34.65 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3799  flagellar biosynthesis repressor FlbT  36.29 
 
 
126 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0687  flagellar FlbT family protein  36.89 
 
 
152 aa  87  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0957504  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1964  flagellar biosynthesis repressor FlbT  35.2 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616772  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1492  flagellar FlbT family protein  34.4 
 
 
139 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5529  flagellar biosynthesis repressor FlbT  37.38 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5763  flagellar FlbT family protein  31.01 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0523  flagellar biosynthesis repressor FlbT  32.81 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5400  flagellar FlbT family protein  30.58 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2371  hypothetical protein  31.15 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.771214  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2541  hypothetical protein  31.09 
 
 
184 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0768  flagellar biosynthesis repressor FlbT  32 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0275  flagellar biosynthesis repressor FlbT  32.03 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2972  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.46 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.229267 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4189  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.92 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6510  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.8 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3553  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.91 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.646501 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1135  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.92 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.405413  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4201  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.68 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.883513  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1040  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.92 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0342  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.75 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463686  normal  0.484811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0374  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.75 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154964  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4160  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30 
 
 
135 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00283786  normal  0.231077 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3880  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30 
 
 
135 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0966721  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1115  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.46 
 
 
138 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0280  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.8 
 
 
149 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743956  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0661  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.16 
 
 
175 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.262146 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3359  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.91 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0698  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.23 
 
 
173 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0046  flagellar biosynthesis repressor FlbT  26.98 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1118  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.64 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0687  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.92 
 
 
173 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.149804  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1703  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.1 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.141944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>