32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5529 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5529  flagellar biosynthesis repressor FlbT  100 
 
 
129 aa  262  8.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1103  flagellar biosynthesis repressor FlbT  77.48 
 
 
142 aa  184  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.268385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1335  flagellar biosynthesis repressor FlbT  75 
 
 
143 aa  177  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2550  flagellar FlbT family protein  51.35 
 
 
130 aa  123  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.998924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4437  flagellar biosynthesis repressor FlbT  47.71 
 
 
126 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3799  flagellar biosynthesis repressor FlbT  46.79 
 
 
126 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1491  flagellar biosynthesis repressor FlbT  48.6 
 
 
125 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.194019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1672  flagellar biosynthesis repressor FlbT  45.87 
 
 
126 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3373  flagellar FlbT family protein  40.98 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438909  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0523  flagellar biosynthesis repressor FlbT  36.94 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3334  flagellar FlbT family protein  37.38 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3744  flagellar FlbT family protein  40.54 
 
 
129 aa  77  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3828  flagellar FlbT family protein  39.64 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0340484 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2857  flagellar FlbT  37.39 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.920076  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1248  flagellar FlbT family protein  29.66 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1409  flagellar FlbT family protein  29.66 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1195  flagellar FlbT family protein  29.46 
 
 
138 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5763  flagellar FlbT family protein  27.1 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0687  flagellar FlbT family protein  31.48 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0957504  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1964  flagellar biosynthesis repressor FlbT  32.08 
 
 
128 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616772  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2889  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.25 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078203  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1492  flagellar FlbT family protein  31.13 
 
 
139 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0275  flagellar biosynthesis repressor FlbT  24.04 
 
 
145 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3880  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.43 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0966721  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4160  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.43 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00283786  normal  0.231077 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4189  flagellar biosynthesis repressor FlbT  26.61 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408027  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4201  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.06 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.883513  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5400  flagellar FlbT family protein  30.1 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2972  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.7 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.229267 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0107  flagellar biosynthesis regulator FlbT-like protein  29.79 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1040  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.47 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1135  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.47 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.405413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>