42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1672 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1672  flagellar biosynthesis repressor FlbT  100 
 
 		 126 aa  253  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3799  flagellar biosynthesis repressor FlbT  96.83 
 
 		 126 aa  249  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4437  flagellar biosynthesis repressor FlbT  92.86 
 
 		 126 aa  240  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1491  flagellar biosynthesis repressor FlbT  86.4 
 
 		 125 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.194019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0523  flagellar biosynthesis repressor FlbT  54.17 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2550  flagellar FlbT family protein  52 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1103  flagellar biosynthesis repressor FlbT  49.19 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.268385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1335  flagellar biosynthesis repressor FlbT  48.39 
 
 		 143 aa  116  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5529  flagellar biosynthesis repressor FlbT  46.73 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3744  flagellar FlbT family protein  41.73 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3373  flagellar FlbT family protein  36.8 
 
 		 139 aa  97.4  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3828  flagellar FlbT family protein  41.27 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0340484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1195  flagellar FlbT family protein  37.1 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3334  flagellar FlbT family protein  36.29 
 
 		 128 aa  87.8  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1409  flagellar FlbT family protein  36.29 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1248  flagellar FlbT family protein  36.29 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2371  hypothetical protein  38.33 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.771214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1964  flagellar biosynthesis repressor FlbT  37.69 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5400  flagellar FlbT family protein  36.67 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0687  flagellar FlbT family protein  33.33 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0957504  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2857  flagellar FlbT  34.88 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.920076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2889  flagellar biosynthesis repressor FlbT  36.92 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078203  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5763  flagellar FlbT family protein  28.23 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2541  hypothetical protein  37.07 
 
 		 184 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1492  flagellar FlbT family protein  32.26 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4201  flagellar biosynthesis repressor FlbT  34.11 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.883513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2972  flagellar biosynthesis repressor FlbT  33.87 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.229267 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3359  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.25 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4160  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.25 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00283786  normal  0.231077 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3880  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.25 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0966721  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1135  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.34 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.405413  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0275  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.91 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1040  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.34 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4189  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.34 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408027  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1115  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.07 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0768  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.68 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0280  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.12 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1118  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.27 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3553  flagellar biosynthesis repressor FlbT  22.22 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.646501 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0046  flagellar biosynthesis repressor FlbT  22.4 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0342  flagellar biosynthesis repressor FlbT  25 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463686  normal  0.484811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0374  flagellar biosynthesis repressor FlbT  25 
 
 		 149 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154964  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>