41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2857 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2857  flagellar FlbT  100 
 
 
148 aa  301  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.920076  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3373  flagellar FlbT family protein  41.86 
 
 
139 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438909  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1964  flagellar biosynthesis repressor FlbT  39.37 
 
 
128 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616772  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3334  flagellar FlbT family protein  41.09 
 
 
128 aa  99.4  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1335  flagellar biosynthesis repressor FlbT  42.54 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1103  flagellar biosynthesis repressor FlbT  42.52 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.268385 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3828  flagellar FlbT family protein  37.31 
 
 
129 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0340484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3744  flagellar FlbT family protein  38.46 
 
 
129 aa  92  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2550  flagellar FlbT family protein  39.1 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.998924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2889  flagellar biosynthesis repressor FlbT  34.88 
 
 
131 aa  87  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078203  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1491  flagellar biosynthesis repressor FlbT  38.93 
 
 
125 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.194019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1672  flagellar biosynthesis repressor FlbT  35.66 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3799  flagellar biosynthesis repressor FlbT  35.66 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4437  flagellar biosynthesis repressor FlbT  35.43 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0523  flagellar biosynthesis repressor FlbT  36.29 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5400  flagellar FlbT family protein  33.6 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5529  flagellar biosynthesis repressor FlbT  38.18 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1409  flagellar FlbT family protein  32.85 
 
 
138 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1248  flagellar FlbT family protein  32.85 
 
 
138 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1195  flagellar FlbT family protein  32.33 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1492  flagellar FlbT family protein  33.83 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5763  flagellar FlbT family protein  30.47 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0687  flagellar FlbT family protein  32.84 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0957504  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2371  hypothetical protein  34.17 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.771214  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2541  hypothetical protein  31.16 
 
 
184 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2972  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.06 
 
 
134 aa  57  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.229267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0275  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.43 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4160  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.24 
 
 
135 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00283786  normal  0.231077 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3880  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.24 
 
 
135 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0966721  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0661  flagellar biosynthesis repressor FlbT  25.6 
 
 
175 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.262146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0698  flagellar biosynthesis repressor FlbT  24.8 
 
 
173 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0107  flagellar biosynthesis regulator FlbT-like protein  28.8 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1118  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.93 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0687  flagellar biosynthesis repressor FlbT  24 
 
 
173 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.149804  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4201  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.46 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.883513  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4189  flagellar biosynthesis repressor FlbT  23.2 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6510  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.34 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3359  flagellar biosynthesis repressor FlbT  24.41 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1040  flagellar biosynthesis repressor FlbT  22.56 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1135  flagellar biosynthesis repressor FlbT  22.56 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.405413  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0768  flagellar biosynthesis repressor FlbT  24.03 
 
 
149 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>