45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2550 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2550  flagellar FlbT family protein  100 
 
 
130 aa  265  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.998924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1103  flagellar biosynthesis repressor FlbT  58.06 
 
 
142 aa  148  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.268385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1335  flagellar biosynthesis repressor FlbT  58.06 
 
 
143 aa  148  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4437  flagellar biosynthesis repressor FlbT  54.84 
 
 
126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3799  flagellar biosynthesis repressor FlbT  52.8 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1491  flagellar biosynthesis repressor FlbT  54.84 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.194019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1672  flagellar biosynthesis repressor FlbT  52 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3373  flagellar FlbT family protein  44.88 
 
 
139 aa  121  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438909  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5529  flagellar biosynthesis repressor FlbT  52.34 
 
 
129 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3334  flagellar FlbT family protein  41.41 
 
 
128 aa  118  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3744  flagellar FlbT family protein  44.88 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3828  flagellar FlbT family protein  44.09 
 
 
129 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0340484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0523  flagellar biosynthesis repressor FlbT  43.08 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1409  flagellar FlbT family protein  39.23 
 
 
138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1248  flagellar FlbT family protein  39.23 
 
 
138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1195  flagellar FlbT family protein  39.37 
 
 
138 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5763  flagellar FlbT family protein  36.29 
 
 
134 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0687  flagellar FlbT family protein  37.3 
 
 
152 aa  94  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0957504  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1964  flagellar biosynthesis repressor FlbT  41.6 
 
 
128 aa  92.8  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616772  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5400  flagellar FlbT family protein  41.67 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1492  flagellar FlbT family protein  37.9 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2857  flagellar FlbT  39.1 
 
 
148 aa  88.2  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.920076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2889  flagellar biosynthesis repressor FlbT  37.69 
 
 
131 aa  84.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078203  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2371  hypothetical protein  32.2 
 
 
188 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.771214  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2541  hypothetical protein  30.51 
 
 
184 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3880  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.13 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0966721  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4160  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.13 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00283786  normal  0.231077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0275  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.03 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0046  flagellar biosynthesis repressor FlbT  22.83 
 
 
136 aa  50.8  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3359  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.47 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0374  flagellar biosynthesis repressor FlbT  25.98 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154964  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0342  flagellar biosynthesis repressor FlbT  25.98 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463686  normal  0.484811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0698  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30 
 
 
173 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0661  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28 
 
 
175 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.262146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0768  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.03 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4189  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.35 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408027  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4201  flagellar biosynthesis repressor FlbT  26.4 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.883513  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0687  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.13 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.149804  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1135  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.21 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.405413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1115  flagellar biosynthesis repressor FlbT  25.95 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3553  flagellar biosynthesis repressor FlbT  24.62 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.646501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6510  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.12 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1040  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.21 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2972  flagellar biosynthesis repressor FlbT  27.91 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.229267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0280  flagellar biosynthesis repressor FlbT  26.92 
 
 
149 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743956  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>