23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2423 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2423  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  685    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3401  hypothetical protein  75.26 
 
 		 335 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2192  hypothetical protein  64.76 
 
 		 372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0854  hypothetical protein  48.78 
 
 		 333 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3095  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  54.24 
 
 		 310 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0691949  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0961  hypothetical protein  48.98 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3416  hypothetical protein  41.51 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4787  hypothetical protein  40.61 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0128  hypothetical protein  39.23 
 
 		 300 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4769  hypothetical protein  38.11 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275018  normal  0.511697 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0970  hypothetical protein  36.26 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.152926  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0399  hypothetical protein  34.07 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.680585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1235  hypothetical protein  28.92 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1125  hypothetical protein  28.71 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6411  hypothetical protein  26.1 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4734  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3435  hypothetical protein  25.61 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0361  hypothetical protein  23.62 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1848  conserved hypothetical secreted protein  25.2 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51214  hitchhiker  0.00000000124644 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5379  hypothetical protein  25.2 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0609  putative lipoprotein  21.47 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.581249 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0362  conserved hypothetical secreted protein  22.9 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.807375  normal  0.507937 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1798  hypothetical protein  22.38 
 
 		 307 aa  46.6  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000750515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>