29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5379 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5379  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1848  conserved hypothetical secreted protein  100 
 
 		 302 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51214  hitchhiker  0.00000000124644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3435  hypothetical protein  61.46 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0361  hypothetical protein  42.2 
 
 		 304 aa  222  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0362  conserved hypothetical secreted protein  43.03 
 
 		 278 aa  198  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.807375  normal  0.507937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0609  putative lipoprotein  37.16 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.581249 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1798  hypothetical protein  29.45 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000750515  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0920  hypothetical protein  28.12 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000510544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0955  hypothetical protein  28.12 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000014544  normal  0.349997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0919  hypothetical protein  28.12 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000244259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3459  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0904  hypothetical protein  25.31 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000046277  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2655  hypothetical protein  26.12 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000824644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0418  hypothetical protein  25.66 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000826848  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0961  hypothetical protein  24.49 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3401  hypothetical protein  24.73 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2192  hypothetical protein  23.98 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3095  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  21.28 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0691949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0854  hypothetical protein  23.48 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2423  hypothetical protein  25.2 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3416  hypothetical protein  23.58 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0128  hypothetical protein  26.9 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4769  hypothetical protein  25.33 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275018  normal  0.511697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1235  hypothetical protein  27.89 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0710  hypothetical protein  22.67 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.03339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6411  hypothetical protein  26.94 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1125  hypothetical protein  26.84 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4787  hypothetical protein  24.88 
 
 		 307 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0399  hypothetical protein  22.8 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.680585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>