29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0961 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0961  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0854  hypothetical protein  81.38 
 
 		 333 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3095  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  76.43 
 
 		 310 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0691949  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2423  hypothetical protein  51.32 
 
 		 339 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3401  hypothetical protein  50.84 
 
 		 335 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2192  hypothetical protein  53.36 
 
 		 372 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3416  hypothetical protein  44.06 
 
 		 303 aa  215  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4787  hypothetical protein  45.98 
 
 		 307 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0128  hypothetical protein  41.3 
 
 		 300 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0970  hypothetical protein  34.17 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.152926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4769  hypothetical protein  39.57 
 
 		 299 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275018  normal  0.511697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0399  hypothetical protein  33.09 
 
 		 322 aa  142  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.680585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1235  hypothetical protein  26.95 
 
 		 330 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1125  hypothetical protein  26.65 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6411  hypothetical protein  26.09 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1848  conserved hypothetical secreted protein  24.49 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51214  hitchhiker  0.00000000124644 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5379  hypothetical protein  24.49 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4734  hypothetical protein  28.05 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0361  hypothetical protein  25.29 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0919  hypothetical protein  25.7 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000244259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0955  hypothetical protein  25.7 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000014544  normal  0.349997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0920  hypothetical protein  25.7 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000510544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3459  hypothetical protein  24.9 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0362  conserved hypothetical secreted protein  23.53 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.807375  normal  0.507937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0904  hypothetical protein  24.9 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000046277  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1798  hypothetical protein  25 
 
 		 307 aa  52.8  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000750515  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0609  putative lipoprotein  24.16 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.581249 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2655  hypothetical protein  23.66 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000824644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3435  hypothetical protein  21.46 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal  0.326123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>