24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3435 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3435  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  670    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1848  conserved hypothetical secreted protein  61.46 
 
 		 302 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51214  hitchhiker  0.00000000124644 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5379  hypothetical protein  61.46 
 
 		 302 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0361  hypothetical protein  38.51 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0362  conserved hypothetical secreted protein  38.1 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.807375  normal  0.507937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0609  putative lipoprotein  36.05 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.581249 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1798  hypothetical protein  27.47 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000750515  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0920  hypothetical protein  27.69 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000510544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0955  hypothetical protein  27.69 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000014544  normal  0.349997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0919  hypothetical protein  27.69 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000244259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3459  hypothetical protein  27.38 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0904  hypothetical protein  27.38 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000046277  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2655  hypothetical protein  26.24 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000824644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2423  hypothetical protein  25.61 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0418  hypothetical protein  26.46 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000826848  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3401  hypothetical protein  23.16 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0710  hypothetical protein  24.2 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.03339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2192  hypothetical protein  21.95 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0128  hypothetical protein  22.11 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3416  hypothetical protein  25.1 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1235  hypothetical protein  32.08 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0961  hypothetical protein  21.46 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1125  hypothetical protein  30.82 
 
 		 330 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4769  hypothetical protein  22.73 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275018  normal  0.511697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>