19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1125 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1235  hypothetical protein  98.48 
 
 		 330 aa  662    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1125  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  676    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6411  hypothetical protein  66.67 
 
 		 333 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4734  hypothetical protein  74.6 
 
 		 220 aa  297  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0970  hypothetical protein  32.38 
 
 		 299 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.152926  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3095  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  29.39 
 
 		 310 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0691949  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0128  hypothetical protein  30.94 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3401  hypothetical protein  29.65 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2192  hypothetical protein  25.84 
 
 		 372 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2423  hypothetical protein  28.71 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0961  hypothetical protein  27.17 
 
 		 333 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0854  hypothetical protein  28.04 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0399  hypothetical protein  26.46 
 
 		 322 aa  99.4  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.680585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4769  hypothetical protein  27.89 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275018  normal  0.511697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4787  hypothetical protein  26.15 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3416  hypothetical protein  26.81 
 
 		 303 aa  89.4  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1848  conserved hypothetical secreted protein  26.84 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51214  hitchhiker  0.00000000124644 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5379  hypothetical protein  26.84 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3435  hypothetical protein  30.82 
 
 		 321 aa  46.2  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal  0.326123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>