21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2192 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2192  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  754    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3401  hypothetical protein  73.86 
 
 		 335 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2423  hypothetical protein  65.9 
 
 		 339 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3095  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  57.99 
 
 		 310 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0691949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0854  hypothetical protein  55.22 
 
 		 333 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0961  hypothetical protein  53.36 
 
 		 333 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3416  hypothetical protein  40.38 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4787  hypothetical protein  42.07 
 
 		 307 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0128  hypothetical protein  40.53 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4769  hypothetical protein  38.11 
 
 		 299 aa  155  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275018  normal  0.511697 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0970  hypothetical protein  35.85 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.152926  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0399  hypothetical protein  36.06 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.680585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1235  hypothetical protein  28.28 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1125  hypothetical protein  25.84 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6411  hypothetical protein  26.62 
 
 		 333 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4734  hypothetical protein  32.04 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1848  conserved hypothetical secreted protein  23.98 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51214  hitchhiker  0.00000000124644 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5379  hypothetical protein  23.98 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3435  hypothetical protein  21.95 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0361  hypothetical protein  21.05 
 
 		 304 aa  50.4  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0609  putative lipoprotein  22.37 
 
 		 305 aa  43.5  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.581249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>