21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6411 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6411  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  686    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1125  hypothetical protein  66.67 
 
 		 330 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1235  hypothetical protein  64.26 
 
 		 330 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4734  hypothetical protein  60.53 
 
 		 220 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0970  hypothetical protein  30.26 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.152926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0128  hypothetical protein  30.07 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3095  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  27.14 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0691949  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4769  hypothetical protein  25.41 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275018  normal  0.511697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0961  hypothetical protein  26.09 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4787  hypothetical protein  27.64 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2423  hypothetical protein  26.1 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0399  hypothetical protein  25.59 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.680585 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3401  hypothetical protein  25.46 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0854  hypothetical protein  25.9 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2192  hypothetical protein  26.62 
 
 		 372 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3416  hypothetical protein  23.25 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0710  hypothetical protein  23.26 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.03339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1848  conserved hypothetical secreted protein  26.94 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51214  hitchhiker  0.00000000124644 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5379  hypothetical protein  26.94 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1798  hypothetical protein  23.81 
 
 		 307 aa  43.5  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000750515  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0418  hypothetical protein  22.54 
 
 		 260 aa  42.7  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000826848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>