27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1798 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1798  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  628  1e-179  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000750515  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0710  hypothetical protein  37.5 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.03339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2655  hypothetical protein  35.5 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000824644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3459  hypothetical protein  36.52 
 
 		 302 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0904  hypothetical protein  36.52 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000046277  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0920  hypothetical protein  34.94 
 
 		 302 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000510544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0955  hypothetical protein  34.94 
 
 		 302 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000014544  normal  0.349997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0919  hypothetical protein  34.94 
 
 		 302 aa  152  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000244259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0418  hypothetical protein  35.83 
 
 		 260 aa  132  6.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000826848  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0609  putative lipoprotein  30.57 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.581249 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5379  hypothetical protein  29.45 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1848  conserved hypothetical secreted protein  29.45 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51214  hitchhiker  0.00000000124644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3435  hypothetical protein  27.47 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0361  hypothetical protein  26.82 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0362  conserved hypothetical secreted protein  25.93 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.807375  normal  0.507937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3095  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  25.09 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0691949  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4787  hypothetical protein  22.18 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4769  hypothetical protein  24.37 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275018  normal  0.511697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0961  hypothetical protein  25 
 
 		 333 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0128  hypothetical protein  24.74 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0854  hypothetical protein  23.55 
 
 		 333 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0399  hypothetical protein  25.5 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.680585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3416  hypothetical protein  25.35 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3401  hypothetical protein  21.45 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2423  hypothetical protein  22.38 
 
 		 339 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6411  hypothetical protein  23.81 
 
 		 333 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0970  hypothetical protein  24 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.152926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>