19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0399 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0399  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  649    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.680585 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0970  hypothetical protein  34.23 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.152926  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3401  hypothetical protein  37.23 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3095  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  33.92 
 
 		 310 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0691949  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2192  hypothetical protein  36.06 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0854  hypothetical protein  33.1 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2423  hypothetical protein  34.07 
 
 		 339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0961  hypothetical protein  33.09 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0128  hypothetical protein  35.23 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4769  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275018  normal  0.511697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3416  hypothetical protein  31.23 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4787  hypothetical protein  31.6 
 
 		 307 aa  119  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1235  hypothetical protein  26.8 
 
 		 330 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1125  hypothetical protein  26.46 
 
 		 330 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6411  hypothetical protein  25.59 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4734  hypothetical protein  27.22 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1798  hypothetical protein  25.5 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000750515  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1848  conserved hypothetical secreted protein  22.8 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51214  hitchhiker  0.00000000124644 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5379  hypothetical protein  22.8 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>