28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0854 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0854  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  678    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0961  hypothetical protein  81.38 
 
 		 333 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3095  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  77.1 
 
 		 310 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0691949  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2423  hypothetical protein  51.68 
 
 		 339 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3401  hypothetical protein  51.18 
 
 		 335 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2192  hypothetical protein  49.25 
 
 		 372 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3416  hypothetical protein  45.21 
 
 		 303 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4787  hypothetical protein  44.06 
 
 		 307 aa  206  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0128  hypothetical protein  42.32 
 
 		 300 aa  202  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0970  hypothetical protein  33.81 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.152926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4769  hypothetical protein  39.51 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275018  normal  0.511697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0399  hypothetical protein  33.1 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.680585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1235  hypothetical protein  27.66 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1125  hypothetical protein  27.33 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6411  hypothetical protein  25.9 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4734  hypothetical protein  26.83 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0361  hypothetical protein  23.62 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1848  conserved hypothetical secreted protein  23.48 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51214  hitchhiker  0.00000000124644 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5379  hypothetical protein  23.48 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0919  hypothetical protein  23.93 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000244259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0955  hypothetical protein  23.93 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000014544  normal  0.349997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0920  hypothetical protein  23.93 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000510544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0362  conserved hypothetical secreted protein  22.75 
 
 		 278 aa  52.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.807375  normal  0.507937 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1798  hypothetical protein  23.55 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000750515  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3459  hypothetical protein  23.63 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0904  hypothetical protein  23.63 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000046277  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0609  putative lipoprotein  21.55 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.581249 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2655  hypothetical protein  23.24 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000824644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>