18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0970 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0970  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  609  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.152926  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0854  hypothetical protein  33.81 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0399  hypothetical protein  34.52 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.680585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0961  hypothetical protein  34.17 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3095  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  33.72 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0691949  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2423  hypothetical protein  36.26 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3401  hypothetical protein  36.09 
 
 		 335 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1235  hypothetical protein  30.49 
 
 		 330 aa  155  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2192  hypothetical protein  35.85 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3416  hypothetical protein  34.85 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1125  hypothetical protein  32.38 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4787  hypothetical protein  30.8 
 
 		 307 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6411  hypothetical protein  30.26 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4769  hypothetical protein  31.34 
 
 		 299 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275018  normal  0.511697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4734  hypothetical protein  30.41 
 
 		 220 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0609  putative lipoprotein  25 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.581249 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1798  hypothetical protein  24 
 
 		 307 aa  43.5  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000750515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>